Microbiote

Le microbiote est une nouvelle appellation de la microflore.

Il s'agit de la population de microorganismes vivant en accord avec son hôte^[1] Le génome du microbiote se dénomme microbiome [1]

Un animal ou un végétal dont le microbiote est connu est dit gnotobiotique (gnotos; connu, biota; biote).

La science qui les étudie est la gnobiologie ^[2].

Acquisition du microbiote

L'enfant nait sans microbiote. Il l'obtient par contamination lors de l'accouchement, puis de son environnement. Dans certaines sociétés le père crache habituellement dans la bouche de l'enfant nouveau né, gestion qui pourrait contribuer à la construction du microbiote de l'enfant, qui obtient aussi de nombreux microbes du contact avec sa mère.

Fonctions

Certains auteurs suggèrent de considérer le microbiote comme entité ou qu'organe métabolique associé à l'organisme de leur porteur ; un organe composé d'un nombre d'organismes pouvant atteindre 10¹³ individus, dominés par des bactéries anaérobies, et pouvant inclure 500 à à peu près 1000 espèces dont le génome collectif est estimé contenir 100 fois plus de gènes que le génome humain. Cet organe symbiote aurait surtout pour fonction de digérer des matériaux que les mammifères et d'autres animaux ne peuvent digérer tels que les polysaccharides végétaux^[3].

Histoire du concept

Après une période hygiéniste ayant mis en avant les aspects dangereux de certains microbes, des approches plus holistiques, surtout développées par l'écologie scientifique ont attiré l'attention des chercheurs sur les symbioses et l'importance de la microflore du tube digestif.

Le microbiote a aussi une grande importance pour l'écodispositif normal de la peau, du vagin, comme pour celui du tube digestif. Il reste néenmoins particulièrement peu étudié et par conséquent mal connu, et ne fait pas l'objet de savoirs partagés de la population occidentale.

Composition

Le microbiote humain est à ce jour constitué de plus de 500 espèces différentes connues.
La diversité d'espèces du microbiote intestinal dominant est spécifique à chaque individu et le nombre d'espèces communes à plusieurs individus est particulièrement restreint (ou nul).

Au plan quantitatif, ce dernier apparaît particulièrement stable au cours du temps pour un individu donné sur une période de 2 mois à 2 ans, quoiqu'il ne soit pas envisageable de définir un microbiote intestinal de l'espèce humaine par le profil d'espèces dominantes.

Chez l'animal

Les ruminants hébergent une quantité particulièrement importante d'espèces symbiotes. La capacité à digérer la cellulose, par exemple chez les ruminants est due à ces hôtes.

Hygiène

Avec l'usage dans l'alimentation de «probiotiques» et ou «prébiotiques», l'idée est de faciliter de bons microbes dans le tube digestif. Si l'hygiène est une obligation, ne pas respecter ses «bons» hôtes est un danger qui permet l'expression de bien des risques.

Liens externes

• (fr) Le microbiote
• (fr) GLOSSAIRE – AISA
• (fr) Innocuité, Qualité et Efficacité des Probiotiques
• (en) gnotobiotic animal
• (en) Germ-free animal

Notes et références

1. ↑ Document Inra (Microbiote, Prébiotiques et probiotiques)
2. ↑ Page sur la gnobiologie (en anglais)
3. ↑ étude PNAS Proc Natl Acad Sci U S A > v. 101 (44) ; Nov 2, 2004, 101 (44)  : 15718–15723. Fredrik Bäckhed et al. «The gut microbiota as an environmental factor that regulates fat storage»

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